做单细胞数据分析，我们当然希望看到一个清晰的降维聚类分群结果，这样才方便做生物学亚群注释，比如前面的例子：人人都能学会的单细胞聚类分群注释，第一次分群就非常漂亮！
但那个毕竟是理想情况下，实际上很多单细胞数据集分析到最后，分群其实很勉强，比如年11月发表的皮肤单细胞文章，标题是：《Transcriptomelandscapeofmyeloidcellsinhumanskinrevealsdiversity,rarepopulationsandputativeDCprogenitors》，链接在：